MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 22155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021881	GAAAA	2	10	128	137	80 %	0 %	20 %	0 %	526464098
2	NC_021881	TCG	2	6	147	152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464098
3	NC_021881	CG	3	6	173	178	0 %	0 %	50 %	50 %	526464098
4	NC_021881	TAT	2	6	179	184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464098
5	NC_021881	AGG	2	6	223	228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464098
6	NC_021881	TC	3	6	262	267	0 %	50 %	0 %	50 %	526464098
7	NC_021881	ATT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464098
8	NC_021881	GAA	2	6	434	439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464098
9	NC_021881	GAC	2	6	458	463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464098
10	NC_021881	CAG	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464098
11	NC_021881	TAC	2	6	537	542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464098
12	NC_021881	TCA	2	6	629	634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464098
13	NC_021881	ATA	2	6	678	683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464098
14	NC_021881	CTG	2	6	714	719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464098
15	NC_021881	ATG	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464098
16	NC_021881	AACT	2	8	945	952	50 %	25 %	0 %	25 %	526464098
17	NC_021881	TGC	2	6	991	996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464098
18	NC_021881	AGT	2	6	1015	1020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464098
19	NC_021881	AAGA	2	8	1022	1029	75 %	0 %	25 %	0 %	526464098
20	NC_021881	GGA	2	6	1054	1059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464098
21	NC_021881	TGC	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464098
22	NC_021881	CAG	2	6	1171	1176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464098
23	NC_021881	GGC	2	6	1201	1206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464098
24	NC_021881	GTT	2	6	1244	1249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464098
25	NC_021881	ATG	2	6	1251	1256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464098
26	NC_021881	ATG	2	6	1265	1270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464098
27	NC_021881	T	6	6	1274	1279	0 %	100 %	0 %	0 %	526464098
28	NC_021881	ATTATG	2	12	1304	1315	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	526464098
29	NC_021881	TCA	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464098
30	NC_021881	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464098
31	NC_021881	AC	3	6	1476	1481	50 %	0 %	0 %	50 %	526464098
32	NC_021881	A	6	6	1518	1523	100 %	0 %	0 %	0 %	526464098
33	NC_021881	TGA	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464098
34	NC_021881	GAA	3	9	1595	1603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464098
35	NC_021881	CAG	2	6	1646	1651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464098
36	NC_021881	A	7	7	1694	1700	100 %	0 %	0 %	0 %	526464098
37	NC_021881	A	6	6	1959	1964	100 %	0 %	0 %	0 %	526464098
38	NC_021881	AGC	2	6	2005	2010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464098
39	NC_021881	ATT	2	6	2013	2018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464098
40	NC_021881	CGT	2	6	2101	2106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464098
41	NC_021881	ACAGC	2	10	2108	2117	40 %	0 %	20 %	40 %	526464098
42	NC_021881	TAT	2	6	2132	2137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464098
43	NC_021881	AGA	2	6	2156	2161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464098
44	NC_021881	TATGG	2	10	2192	2201	20 %	40 %	40 %	0 %	526464098
45	NC_021881	ACA	2	6	2306	2311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464098
46	NC_021881	A	6	6	2323	2328	100 %	0 %	0 %	0 %	526464098
47	NC_021881	GGA	2	6	2355	2360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464098
48	NC_021881	AGT	2	6	2402	2407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464098
49	NC_021881	A	6	6	2464	2469	100 %	0 %	0 %	0 %	526464098
50	NC_021881	ATT	2	6	2533	2538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464098
51	NC_021881	AGA	2	6	2551	2556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464098
52	NC_021881	TGA	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464098
53	NC_021881	AAG	2	6	2586	2591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464098
54	NC_021881	CTG	2	6	2887	2892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464099
55	NC_021881	TGT	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464099
56	NC_021881	AGAGA	2	10	2949	2958	60 %	0 %	40 %	0 %	526464099
57	NC_021881	AGC	2	6	2960	2965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464099
58	NC_021881	TGATG	2	10	2999	3008	20 %	40 %	40 %	0 %	526464099
59	NC_021881	TGA	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464099
60	NC_021881	ATC	2	6	3118	3123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464099
61	NC_021881	TAA	2	6	3196	3201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464099
62	NC_021881	A	6	6	3222	3227	100 %	0 %	0 %	0 %	526464099
63	NC_021881	CAC	2	6	3255	3260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464099
64	NC_021881	GGA	2	6	3327	3332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464099
65	NC_021881	A	6	6	3356	3361	100 %	0 %	0 %	0 %	526464099
66	NC_021881	GAT	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464099
67	NC_021881	TCA	2	6	3396	3401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464099
68	NC_021881	TGG	2	6	3422	3427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464099
69	NC_021881	GTT	2	6	3480	3485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464099
70	NC_021881	TGC	2	6	3500	3505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464099
71	NC_021881	T	9	9	3594	3602	0 %	100 %	0 %	0 %	526464100
72	NC_021881	GCT	2	6	3603	3608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464100
73	NC_021881	T	6	6	3658	3663	0 %	100 %	0 %	0 %	526464100
74	NC_021881	CTAT	2	8	3701	3708	25 %	50 %	0 %	25 %	526464100
75	NC_021881	T	6	6	3726	3731	0 %	100 %	0 %	0 %	526464100
76	NC_021881	TC	3	6	3745	3750	0 %	50 %	0 %	50 %	526464100
77	NC_021881	TAG	2	6	3757	3762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464100
78	NC_021881	ACAGA	2	10	3960	3969	60 %	0 %	20 %	20 %	526464100
79	NC_021881	TGT	2	6	4097	4102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464100
80	NC_021881	GAG	2	6	4144	4149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464100
81	NC_021881	ACA	2	6	4284	4289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464100
82	NC_021881	AGC	2	6	4301	4306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464100
83	NC_021881	TA	3	6	4332	4337	50 %	50 %	0 %	0 %	526464100
84	NC_021881	T	6	6	4345	4350	0 %	100 %	0 %	0 %	526464100
85	NC_021881	GTAGT	2	10	4355	4364	20 %	40 %	40 %	0 %	526464100
86	NC_021881	CAA	3	9	4403	4411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464101
87	NC_021881	G	6	6	4447	4452	0 %	0 %	100 %	0 %	526464101
88	NC_021881	GTA	2	6	4650	4655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464101
89	NC_021881	AGG	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464101
90	NC_021881	GGCTTT	2	12	4700	4711	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	526464101
91	NC_021881	TAT	2	6	4811	4816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464101
92	NC_021881	TAT	2	6	4928	4933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464101
93	NC_021881	GGT	2	6	4995	5000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464101
94	NC_021881	A	6	6	5033	5038	100 %	0 %	0 %	0 %	526464101
95	NC_021881	TTA	2	6	5341	5346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464724
96	NC_021881	TAT	2	6	5359	5364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464724
97	NC_021881	ATG	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464724
98	NC_021881	ATG	2	6	5407	5412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464724
99	NC_021881	ATG	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464724
100	NC_021881	TTC	2	6	5500	5505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464724
101	NC_021881	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464725
102	NC_021881	GGA	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464725
103	NC_021881	TGT	2	6	6275	6280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464725
104	NC_021881	AG	3	6	6319	6324	50 %	0 %	50 %	0 %	526464725
105	NC_021881	A	6	6	6340	6345	100 %	0 %	0 %	0 %	526464725
106	NC_021881	GTG	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464725
107	NC_021881	AAAG	2	8	6402	6409	75 %	0 %	25 %	0 %	526464725
108	NC_021881	GATT	2	8	6456	6463	25 %	50 %	25 %	0 %	526464725
109	NC_021881	TCA	2	6	6538	6543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464725
110	NC_021881	ATTT	2	8	6584	6591	25 %	75 %	0 %	0 %	526464725
111	NC_021881	T	6	6	6603	6608	0 %	100 %	0 %	0 %	526464725
112	NC_021881	TTTG	2	8	6621	6628	0 %	75 %	25 %	0 %	526464725
113	NC_021881	TAT	2	6	6642	6647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464725
114	NC_021881	A	6	6	6672	6677	100 %	0 %	0 %	0 %	526464725
115	NC_021881	TCC	2	6	6682	6687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464725
116	NC_021881	CTA	2	6	6779	6784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464725
117	NC_021881	TA	3	6	6783	6788	50 %	50 %	0 %	0 %	526464725
118	NC_021881	GGA	2	6	6799	6804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464725
119	NC_021881	GGTT	2	8	6817	6824	0 %	50 %	50 %	0 %	526464725
120	NC_021881	ATA	2	6	6841	6846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464725
121	NC_021881	TGA	2	6	6897	6902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464725
122	NC_021881	TCGTA	2	10	6909	6918	20 %	40 %	20 %	20 %	526464725
123	NC_021881	TGA	2	6	6936	6941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464725
124	NC_021881	AG	3	6	7100	7105	50 %	0 %	50 %	0 %	526464102
125	NC_021881	TGCT	2	8	7110	7117	0 %	50 %	25 %	25 %	526464102
126	NC_021881	TGT	2	6	7183	7188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464102
127	NC_021881	GAA	3	9	7214	7222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464102
128	NC_021881	TGG	2	6	7318	7323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464102
129	NC_021881	ATT	2	6	7341	7346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464102
130	NC_021881	GT	3	6	7377	7382	0 %	50 %	50 %	0 %	526464102
131	NC_021881	AAG	2	6	7424	7429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464102
132	NC_021881	TGC	2	6	7465	7470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464102
133	NC_021881	TAG	2	6	7477	7482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464102
134	NC_021881	GCG	2	6	7539	7544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464102
135	NC_021881	T	6	6	7554	7559	0 %	100 %	0 %	0 %	526464102
136	NC_021881	TGATAT	2	12	7582	7593	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	526464102
137	NC_021881	T	6	6	7599	7604	0 %	100 %	0 %	0 %	526464102
138	NC_021881	AT	3	6	7615	7620	50 %	50 %	0 %	0 %	526464102
139	NC_021881	TGG	2	6	7677	7682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464102
140	NC_021881	AAAG	2	8	7693	7700	75 %	0 %	25 %	0 %	526464102
141	NC_021881	ATTA	2	8	7894	7901	50 %	50 %	0 %	0 %	526464103
142	NC_021881	CT	3	6	7910	7915	0 %	50 %	0 %	50 %	526464103
143	NC_021881	TA	3	6	8002	8007	50 %	50 %	0 %	0 %	526464103
144	NC_021881	ATTG	2	8	8117	8124	25 %	50 %	25 %	0 %	526464103
145	NC_021881	CTAG	2	8	8181	8188	25 %	25 %	25 %	25 %	526464103
146	NC_021881	TAC	2	6	8198	8203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464103
147	NC_021881	CCG	2	6	8280	8285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526464103
148	NC_021881	CCT	2	6	8355	8360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464103
149	NC_021881	TCT	2	6	8397	8402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464103
150	NC_021881	CATC	2	8	8408	8415	25 %	25 %	0 %	50 %	526464103
151	NC_021881	GAT	2	6	8427	8432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464103
152	NC_021881	TTG	2	6	8465	8470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464103
153	NC_021881	TCA	2	6	8481	8486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464103
154	NC_021881	TGC	2	6	8487	8492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464103
155	NC_021881	CTT	2	6	8711	8716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464103
156	NC_021881	CT	3	6	8786	8791	0 %	50 %	0 %	50 %	526464103
157	NC_021881	TCCT	2	8	8801	8808	0 %	50 %	0 %	50 %	526464103
158	NC_021881	TC	3	6	8823	8828	0 %	50 %	0 %	50 %	526464103
159	NC_021881	ACT	2	6	8841	8846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464103
160	NC_021881	TCC	2	6	8859	8864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464103
161	NC_021881	CTA	2	6	8866	8871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464103
162	NC_021881	AGT	2	6	8962	8967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464103
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164	NC_021881	ACTC	2	8	9025	9032	25 %	25 %	0 %	50 %	526464103
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167	NC_021881	TATC	2	8	9054	9061	25 %	50 %	0 %	25 %	526464103
168	NC_021881	TAC	2	6	9342	9347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464104
169	NC_021881	TGT	2	6	9350	9355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464104
170	NC_021881	GGT	2	6	9363	9368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464104
171	NC_021881	TG	3	6	9385	9390	0 %	50 %	50 %	0 %	526464104
172	NC_021881	AT	3	6	9412	9417	50 %	50 %	0 %	0 %	526464104
173	NC_021881	TAG	2	6	9424	9429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464104
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175	NC_021881	ATG	2	6	9526	9531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464104
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182	NC_021881	A	8	8	9761	9768	100 %	0 %	0 %	0 %	526464104
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199	NC_021881	TAT	2	6	11728	11733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464726
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250	NC_021881	AG	3	6	14626	14631	50 %	0 %	50 %	0 %	526464106
251	NC_021881	TAA	2	6	14691	14696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464106
252	NC_021881	TGCGA	2	10	14759	14768	20 %	20 %	40 %	20 %	526464106
253	NC_021881	AGA	2	6	14769	14774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464106
254	NC_021881	GTTGAT	2	12	14804	14815	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	526464106
255	NC_021881	CTT	2	6	14823	14828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464106
256	NC_021881	GAA	2	6	14873	14878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464106
257	NC_021881	AT	3	6	14925	14930	50 %	50 %	0 %	0 %	526464106
258	NC_021881	A	6	6	14942	14947	100 %	0 %	0 %	0 %	526464106
259	NC_021881	GTA	2	6	15036	15041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464106
260	NC_021881	GTG	2	6	15076	15081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464106
261	NC_021881	TA	3	6	15120	15125	50 %	50 %	0 %	0 %	526464106
262	NC_021881	AGT	2	6	15212	15217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464106
263	NC_021881	GAT	2	6	15254	15259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464106
264	NC_021881	AGTA	2	8	15471	15478	50 %	25 %	25 %	0 %	526464107
265	NC_021881	GAA	2	6	15490	15495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464107
266	NC_021881	AAG	2	6	15502	15507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464107
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392	NC_021881	GTG	2	6	21717	21722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464112
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